为保障基层医疗卫生机构实施基本药物制度，省财政遵循“突出改革、转变机制，注重实效、激励先进，绩效考核、量效挂钩，管理规范、确保安全”的原则，在资金管理上采取四项措施，支持推动我省基本药物制度不断完善。
一是资金安排足额保障。在每年省级预算安排中，按照既定的省级补助标准，综合考虑各地服务人口数量、财力状况等因素，坚持将省级补助资金预算打足打实，为基层基本药物制度实施提供资金保障。
二是资金拨付快速到位。省级补助资金按照先预拨后结算原则，采取一般转移支付方式下达市县，坚持做到早安排、早下达、早见效，不仅加快资金拨付和实际支出进度，而且确保资金及时、足额到位。2014年11月，省财政就提前下达2015年补助资金6.73亿元，其中省级补助资金4.14亿元已全额预拨到位。
三是资金管理高效安全。为加强财政补助资金管理，研究制定《基层医疗卫生机构实施国家基本药物制度补助资金管理办法》，建立常态化的绩效管理工作机制，将绩效考核结果与补助资金分配挂钩，资金拨付与医疗机构服务数量、质量和绩效考核结果挂钩。
四是资金使用效益为先。建立全方位监督机制，加大审计、监督力度，确保财政补助资金真正落实到基层群众身上。提高群众满意度在绩效考核中所占比重，绩效考核结果按规定向社会公开，接受社会监督。